Simulation par docking moléculaire des interactions protéine -ligand: Cas de cancer du colon
| dc.contributor.author | BENOUADFEL , Besma | |
| dc.contributor.author | GOUSMI , Tinhinen-chahinez | |
| dc.contributor.author | BENLAMRI , Yasmine | |
| dc.contributor.author | AMOR , Loubna Encadrante | |
| dc.date.accessioned | 2026-11-09T10:32:40Z | |
| dc.date.issued | 2026 | |
| dc.description | سرطان القولون والمستقيم (CCR) هو من أكثر أنواع السرطان شيوعاً و فتكاً في العالم. وعلى الرغم من وجود علاجات موجهة تستهدف البروتينات المشاركة في تطوره مثل EGFR و VEGFR و BRAF،فإن القيود المرتبطة بالآثار الجانبية والمقاومة و التكاليف المرتفعة تفرض ضرورة البحث عن بدائل علاجية جديدة. تقدم مذكرتنا منهجية مبتكرة تعتمد على الإرساء الجزيئي لتحديد مثبطات جديدة لأهداف جزيئية رئيسية. وباستخدام برنامجAutoDock Vina،قمنا بتقييم قدرة الارتباط لثلاثة مركبات طبيعية (curcumine،quercetine،resveratrol) تجاه هذه البروتينات المستهدفة، ومقارنتها بأدوية مرجعية مستخدمة في العلاجات الموجهة: cetuximab،regorafenib،vemurafenib. وأظهرت النتائج أنquercetine يندمج بشكل مستقروانتقائي في المواقع الفعالة لـ EGFR وVEGFR بشراهة قدرها -9,0 و -9.9 كيلوكالوري/مول على التوالي، في حين تميزresveratrolبأعلى استقرار مع BRAF بشراهة قدرها -9.3 كيلوكالوري/مول. وتتعززهذه التفاعلات من خلال إنشاء شبكات تفاعلات مُثبِّتة، خاصة الروابط الهيدروجينية والتفاعلات الكارهة للماء. علاوة على ذلك، تشير خصائص ADME والتقييم السمي للمركبات المدروسة إلى حركية دوائية مثالية وسمية منخفضة، مما يدعم إمكاناتها العلاجية | |
| dc.description.abstract | Colorectal cancer (CRC) is one of the most common and deadly cancers worldwide. Despite the existence of targeted therapies directed against proteins involved in its progression, such as EGFR, VEGFR, and BRAF, limitations related to side effects, resistance, and high costs call for the search for new therapeutic alternatives. Our thesis presents an innovative methodology based on molecular docking for the identification of new inhibitors of key molecular targets. Using AutoDock Vina software, we evaluated the binding capacity of three natural compounds (curcumin, quercetin, and resveratrol) toward these target proteins, comparing them to reference drugs used in targeted therapies: cetuximab, regorafenib, and vemurafenib. The results revealed that quercetin binds in a stable and selective manner within the active sites of EGFR and VEGFR, with respective binding affinities of -9.0 and -9.9 kcal/mol, while resveratrol showed the strongest stability with BRAF, with a binding affinity of -9.3 kcal/mol. These interactions are reinforced through the establishment of stabilizing interaction networks, notably hydrogen bonds and hydrophobic interactions. Furthermore, the ADME properties and toxicological evaluation of the studied compounds suggest an optimal pharmacokinetic profile and reduced toxicity, supporting their therapeutic potential | |
| dc.description.sponsorship | Le cancer colorectal (CCR) est l'un des cancers les plus fréquents et meurtriers au monde. Malgré l'existence de thérapies ciblées dirigées contre des protéines impliquées dans sa progression telles qu'EGFR, VEGFR et BRAF, les limitations liées aux effets secondaires, aux résistances, aux coûts élevés imposent la recherche de nouvelles alternatives thérapeutiques. Notre mémoire présente une méthodologie novatrice basée sur le docking moléculaire pour l'identification de nouveaux inhibiteurs de cibles moléculaires clés. A l’aide du logiciel AutoDock Vina, nous avons évalué la capacité de liaison de trois composés naturels (la curcumine, la quercetine, le resveratrol) vis-à-vis de ces protéines cibles, en les comparant à des médicaments de référence utilisés en thérapies ciblées : cetuximab, regorafenib, vemurafenib. Les résultats ont révélé que la quercétine s'insère de manière stable et sélective dans les sites actifs d’EGFR et VEGFR avec des affinités respectives de -9.0 et -9.9 kcal/mol , tandis que le resvératrol se distingue par la plus forte stabilité avec BRAF avec une affinité de -9.3 kcal/mol. Ces interactions sont renforcées via l’établissement de réseaux d'interactions stabilisatrices notamment des liaisons hydrogène et des interactions hydrophobes. Par ailleurs, les propriétés ADME et l’évaluation toxicologique des composés étudiés suggèrent leur profil pharmacocinétique optimal et une toxicité réduite, soutenant leur potentiel thérapeutique. | |
| dc.identifier.other | BS-CD 17---MS-2639 | |
| dc.identifier.uri | https://repository.univ-setif.dz/handle/123456789/3983 | |
| dc.language.iso | fr | |
| dc.publisher | Université Setif 1 Ferhat Abbas . Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie | |
| dc.subject | Cancer colorectal | |
| dc.subject | docking moléculaire | |
| dc.subject | EGFR | |
| dc.subject | VEGFR | |
| dc.subject | BRAF | |
| dc.subject | composés naturels | |
| dc.subject | thérapies ciblées. | |
| dc.title | Simulation par docking moléculaire des interactions protéine -ligand: Cas de cancer du colon | |
| dc.type | Thesis |